Équipements

Analyse et stockage des données
  • Gestion des données biologiques et chimiques, analyses statistiques et calculs IC50:
  • Suite ActivityBase ver. 7.4.4.8 de IDBS
  • Serveur IBM X366 :
    • Serveur de type IBM à 4 processeurs (8 Go de mémoire)
    • Stockage de données sur environnement de fibre optique
    • (solution de redondance RAID intégrée)
    • Sauvegarde de données sur médias de type LTO
Caractéristiques des librairies
  • Chembridge DiverSet : 60000 composés (chembridge.com)
  • Maybridge HitFinder™ : 16000 composés
  • Maybridge (sélectionnés) : 16000 composés (maybridge.com)
  • SPECS (sélectionnés) : 16000 composés (specs.net)
  • Microsource Discovery Spectrum : 2000 composés (msdiscovery.com)
  • Biomol (produits naturels) : 500 composés (biomol.com)
  • Prestwick (produits commercialisés) : 1120 composés (prestwickchemical.fr)
  • SIGMA LopacTM : 1280 (sigmaaldrich.com)
  • Collection interne (synthétisés à l’UdeM) : 3000 composés
Criblage fonctionnel
  • Librairie MissionTM TRC1 shRNA SIGMA (sigmaaldrich.com) :
    • plus de 150000 plasmides couvrant environ 16000 gènes humains et murins
    • près de 50 000 clones de lentivirus (606 plaques de 96 puits) prêts à cribler (3 clones par gènes) pour l’humain et la souris (titres moyens 5X106 particules/ml)
  • Librairie RNAi Drosophile Open Biosystems (openbiosystems.com):
    • 15000 dsRNA produits par transcription in vitro
    • 52 plaques de 384 prêtes à cribler (concentration de 0.2 ou 0.05 µg/µl)
Station de pipettage semi-automatique
  • Station de pipettage Biomek FX équipée d’une tête 96-puits/250μl et d’une tête “Span-8” avec lecteur de code à barres (Beckman)
  • Un stacker carousel (jusqu’à 120 microplaques)
  • Installé dans une hotte biologique de classe II
Système de criblage à haut contenu d’information (High content screening)

Operetta (Perkin-Elmer)

  • Objectifs longue distance 20X et 40X
  • Filtres Excitation :
    • 360-400 nm
    • 460-490 nm
    • 520-550 nm
  • Filtres Emission :
    • 410-480 nm
    • 500-550 nm
    • 560-630 nm
    • 650-760 nm
  • Logiciel de contrôle et d’analyse Harmony 3.5.1

Opera (Perkin-Elmer)

  • Objectifs : 20X air, 20X , 40X et 60 X (immersion à l’eau)
  • Lasers :
    • Bleu : 488 nm
    • Jaune : 561 nm
    • Rouge : 640 nm
    • Violet: 445 nm
  • Lampe UV: 360-410 nm
  • T-LED: 690 nm
  • Camera 1 High QE CCD
  • Camera 2 High QE CCD
  • Camera 3 High QE CCD
  • Camera 4 Camera UV
  • Logiciel d’analyse Acapella 2.6
  • Intégré avec un robot Plate-Handler VP5243M (Perkin-Elmer)
  • Hôtel 42 positions
  • Unité de contrôle de la température, du CO2 et de l’humidité
Système robotique intégré 1 (Thermo)
  • Station de pipettage Biomek FX équipé d’une tête 96-puits/250μl et d’une tête “Span-8” (Beckman)
  • Distributeurs en vrac: Thermo Multidrop 384 (2)
  • Laveur de plaques Biotek ELx405 (compatible avec plaques de 96- et 384 puits)
  • Incubateur à CO2 Cytomat 6001 (Thermo) automatisé à haute capacité (jusqu’à 189 microplaques)
  • Carrousel ambiant (jusqu’à 180 microplaques)
  • Lecteur de codes barres
  • Lecteur de plaques Envision (Perkin-Elmer) :
    • Densité optique
    • Luminescence et luminescence accrue
    • Intensité de fluorescence normale et en temps résolu (TRF)
    • Polarisation de fluorescence
    • FRET, BRET
    • AlphaScreen
    • Plaques de 96, 384 et 1536 puits
  • Lecteur de plaques NEO (Biotek) :
    • Luminescence
    • Intensité de fluorescence normale et en temps résolu (TRF)
    • Polarisation de fluorescence
    • FRET, BRET I et II
    • HTRF
    • AlphaScreen
    • Plaques de 96, 384 et 1536 puits
Système robotique intégré 2 (bras robotisé CRS F3 de Thermo)
  • Installés dans une hotte biologique de classe II : Stations de pipettage Biomek NX (Beckman) équipé d’une tête 96-puits/250μl et Biomek NX équipé d’une tête “Span-8”
  • Distributeurs en vrac: Thermo Multidrop Combi 384 et Multidrop 384
  • Laveur de plaques Biotek ELx405 Select CW (compatible avec plaques de 96- et 384 puits)
  • Centrifugeuse de microplaques V-Spin
  • Incubateur à CO2 Cytomat 6001 (Thermo) automatisé à haute capacité (jusqu’à 81 plaques)
  • Incubateur à température ambiante ou réfrigéré Cytomat 6002 (Thermo) automatisé à haute capacité (jusqu’à 81 plaques)
  • Carrousel ambiant (jusqu’à 88 plaques ou boîtes d’embouts)
  • Lecteur de barcodes
  • Lecteur de plaques NEO (Biotek) :
    • Luminescence
    • Intensité de fluorescence normale et en temps résolu (TRF)
    • Polarisation de fluorescence
    • FRET, BRET I et II
    • HTRF
    • AlphaScreen
    • Plaques de 96, 384 et 1536 puits

 

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